Non toutes les personnes condamnées ne figurent pas au FIJAISV.

L'inscription au FIJAIS est obligatoire et automatique en cas de condamnation pour l'un des crimes sexuels listés à l'article 706-47 du Code de procédure pénale. En matière de délits, l'inscription est également automatique si la peine maximale encourue est supérieure à cinq ans d'emprisonnement. D’en d’autres cas, l’inscription au FIJAISV est laissée à l’appréciation de la juridiction. 

En ce qui concerne les mineurs, leur inscription peut être effectuée sur décision expresse de la juridiction ou du procureur de la République s'il s'agit d'un mineur âgé de 13 à 18 ans, en cas de délit relevant de l'article 706-47 du Code de Procédure Pénale.

En revanche, les décisions concernant les mineurs de moins de 13 ans ne sont pas enregistrées dans le FIJAISV.